杨康遗孤杨过往陆家庄欲投靠陆庄主，但陆庄主被赤练仙子李莫愁寻仇杀害，过得郭靖相救，并得全真派老道长收留。一日，杨过被众小道士欺负，孙婆婆代为解围，遭小道士重伤，临终托古墓派传人小龙女收杨过为徒。转瞬十年，杨过已长英俊少年，随小龙女朝夕习武，情愫渐生。小龙女练玉女心经时，因受惊致吐血不止，杨过割臂输血相救。愁于此时重返古墓，欲夺回师妹小龙女手上的玉女心经。小龙女和杨过合力迎战仍不敌，急关墓门欲和愁同归于尽，幸及时发现秘密地道，即偕杨过逃出古墓。

杨过和小龙女逃出古墓后，隐居荒山。小龙女遭全真派的尹志平轻薄，却误以为是杨过，及后见杨过若无其事，即负气出走。杨过下山寻小龙女，偶遇陆无双。双因偷走李莫愁从古墓夺得的玉女心经而被愁追杀，杨过助双逃亡。李莫愁发现杨过，大打出手，杨过得洪七公相救，并得其授予打狗棒法。丐帮举行盛典，各派豪杰聚集桃花岛，金国霍都王子、金轮法王及愁突然前来挑衅，杨过和久别重逢的小龙女上阵迎战，大败三魔头。

过和小龙女规划成亲，但小龙女经黄蓉苦劝后，恐师徒恋误杨过前程，决悄然离别。杨过追寻小龙女，遇老顽童周伯通，结为忘年知交。小龙女忧伤咯血，得绝情谷谷主相救，小龙女感恩下嫁。大婚之日，霍都王子前来抢亲，被追寻小龙女而至的杨过打败。谷主因妒杨过和小龙女情深难舍而动武，杨过不敌被擒，和小龙女同遭有毒的绝情花刺伤。谷主被妻女裘千尺和绿萼制伏，尺逼过在十五天取回郭靖夫妇头颅，代她报杀兄之以换取解药，杨过遂偕小龙女往襄阳伺机行事。

襄阳被忽必烈所领蒙古兵围困，郭靖、黄蓉夫妇奋力顽抗，以为杨过和小龙女前来相助，大表欢迎。武氏兄弟郭儒和修文出城杀烈，事败被擒，郭靖赴蒙古军营相救，险遭金轮法王刺杀，幸得杨过拔刀相助。金轮法王入城放火，临盆在即的黄蓉得小龙女保护脱险，过施计引走金轮法王。武敦儒被金轮法王的毒器所伤，杨过为武敦儒吮出毒血，不料以毒攻毒，杨过身上的情花毒亦随之化解。郭靖助杨过重返古墓和小龙女重聚，并邀二人返襄阳城成亲，有情人终成眷属。

金庸对于十四部武侠小说的改编，大多都是改编正文内容的，很少有改小说书名的，当然除了《神雕侠侣》，很多人也许不了解，《神雕侠侣》原本不叫《神雕侠侣》，在明报连载的，也是最早版本的叫《天残地缺》。

神雕侠侣最早版本出自于明报的连载版

后来，金庸封笔之后，通过多年不断的修改又有了后来的三联版和新世纪版。流传最广的就是后来的三联版。

最早的版本是金庸在香港《明报》发表的连载小说，它是金庸的第五部武侠小说，第一次刊登在自家的报纸上，为明报在香港站稳脚跟起决定性影响，可以在金庸网上看到这一最早版本。